De ouders van Billy Betoel drijven een Indisch restaurant op een waddeneiland. Billy’s vader, een gedreven Indische kok, voelt zich steeds minder op zijn gemak – hij heeft een afkeer van het eiland en zijn huwelijk dreigt op de klippen te lopen. Het gezin Betoel staat onder hoogspanning, maar Billy gaat geheel op in de door Mollukse jongeren uitgevoerde treinkaping bij De Punt. Billy fantaseert over het heroïsche kapersleven, maar ook over het bizarre Lot van de gijzelaars, terwijl zich in zijn directe omgeving, ongemerkt, een drama voltrekt.
Noorderzon vertelt het indringende verhaal van drie cruciale weken in het leven van een gevoelige jongen, die langzaam maar zeker in verzet komt tegen zijn iets oudere zus Rosa, tegen zijn ouders, en tegen de eilandbewoners, die niet nalaten hem het gevoel te geven dat hij anders is. In het zilte, weidse, van mysterie doortrokken waddenlandschap ontrolt zich een aangrijpende tragedie van een jongen die tegen willen dank de echte wereld ontdekt.